Cuando salgas...

wikke

A mí me parece que la diferencia aquí es el mezclar
no permitido de las personas:

Cuando salgas (segunda), cierra (tercera) bien la puerta
Cuando salgas (segunda), cierras (segunda) bien la puerta

Por lo tanto la segunda es la correcta, la primera no es correcta.

En la primera, "cierra" es segunda persona del presente de imperativo, no tercera del presente de indicativo 

Sanz

Cuando salgas, cierras bien la puerta.

No sé por qué me suena familiar esta oración...

Tal vez no sea gramaticalmente correcta, pero se usa.

Se puede justificar porque el imperativo es solo para el presente: cierra (ahora). En cambio, para el futuro se puede emplear el indicativo (nunca el futuro: cuando salgas, cerrarás la puerta).

Sí, sí, parecen instrucciones.

En verdad, me trae a la mente una receta de cocina:

Bates la margarina y luego echas el azúcar. Una vez uniforme la mezcla, añades dos yemas de huevo...